Modelar bancos de dados é uma tarefa do cotidiano de muitos desenvolvedores por aí, e quem usa linux pode ter problemas em se identificar com uma ferramente legal e todo mundo que já usou o MySQL-WorkBench no Windows ou no Mac sabe que é o melhor software para isso.
Eu sempre usei o PowerArchitect para modelar no Linux, mas recentemente consegui uma dica para instalar o MySQL-WorkBench no Ubuntu e vou deixar aqui para consultas futuras.

Primeiramente adicione o repositório PPA:
$ sudo add-apt-repository ppa:olivier-berten/misc

Atualize seu APT:
$ sudo apt-get update

Agora é só mandar o APT instalar:
$ sudo apt-get install mysql-workbench-gpl

Guardado na memória!